合成儀無(wú)需模板和引物、DNA聚合酶，而是按照人們預(yù)先設(shè)定的DNA序列，從無(wú)到有，從頭合成（denove），以循環(huán)的化學(xué)反應(yīng)合成出DNA鏈（**個(gè)是掛在固相載體上的，以后每次反應(yīng)通過(guò)提供底物-連接反應(yīng)-洗滌等步驟），而且是單鏈。
PCR儀需要模板、引物和聚合酶，本質(zhì)是生物合成，一般采用一對(duì)引物，合成的是雙鏈DNA，無(wú)需固相載體。合成的模板序列可以是已知的也可以是未知的。
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